Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm17727E9Q4V7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm17727E9Q4V7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm17727E9Q4V7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm17727E9Q4V7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm17727E9Q4V7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm17727E9Q4V7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm17727E9Q4V7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm17727E9Q4V7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17727E9Q4V7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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