Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms