Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ApobE9Q414 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms