Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm17258-201ENSMUST00000168462 1266 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm43903-201ENSMUST00000205126 617 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3250E9Q1M3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms