Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fndc1E9Q043 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms