Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms