Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms