Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Clrn2B2RVW2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms