Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms