Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ssxb8B1AY40 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ssxb8B1AY40 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ssxb8B1AY40 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ssxb8B1AY40 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ssxb8B1AY40 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ssxb8B1AY40 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ssxb8B1AY40 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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