Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr29B1ARI9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Olfr700-202ENSMUST00000214840 1505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms