Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam43bA2AM80 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Fam43bA2AM80 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Fam43bA2AM80 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Fam43bA2AM80 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Fam43bA2AM80 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Fam43bA2AM80 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Fam43bA2AM80 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Fam43bA2AM80 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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