Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lcn6A2AJB9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms