Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms