Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms