Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Itgb4A2A863 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itgb4A2A863 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms