Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm28036V9GXJ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28036V9GXJ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm28036V9GXJ1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm28036V9GXJ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm28036V9GXJ1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28036V9GXJ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28036V9GXJ1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28036V9GXJ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28036V9GXJ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28036V9GXJ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28036V9GXJ1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28036V9GXJ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28036V9GXJ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28036V9GXJ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28036V9GXJ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms