Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt6bQ9Z331 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt6bQ9Z331 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt6bQ9Z331 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms