Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdpk1Q9Z2A0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms