Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trip6Q9Z1Y4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Trip6Q9Z1Y4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms