Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tusc2Q9WVF8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms