Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn5Q9WVD4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn5Q9WVD4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms