Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VapaQ9WV55 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VapaQ9WV55 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VapaQ9WV55 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VapaQ9WV55 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VapaQ9WV55 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VapaQ9WV55 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VapaQ9WV55 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VapaQ9WV55 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapaQ9WV55 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapaQ9WV55 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapaQ9WV55 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapaQ9WV55 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapaQ9WV55 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapaQ9WV55 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapaQ9WV55 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapaQ9WV55 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VapaQ9WV55 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms