Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfsf13bQ9WU72 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms