Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scnn1gQ9WU39 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Scnn1gQ9WU39 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Scnn1gQ9WU39 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Scnn1gQ9WU39 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Scnn1gQ9WU39 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scnn1gQ9WU39 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scnn1gQ9WU39 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms