Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scnn1bQ9WU38 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scnn1bQ9WU38 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms