Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfdn5Q9WU28 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn5Q9WU28 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms