Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp18Q9WTV6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp18Q9WTV6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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Usp18Q9WTV6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Usp18Q9WTV6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp18Q9WTV6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp18Q9WTV6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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