Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PplQ9R269 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PplQ9R269 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PplQ9R269 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PplQ9R269 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PplQ9R269 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PplQ9R269 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PplQ9R269 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PplQ9R269 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PplQ9R269 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PplQ9R269 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PplQ9R269 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PplQ9R269 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PplQ9R269 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PplQ9R269 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PplQ9R269 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PplQ9R269 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms