Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TfebQ9R210 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TfebQ9R210 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms