Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim3Q9R1R2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim3Q9R1R2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim3Q9R1R2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms