Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms