Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb3Q9R1P1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb3Q9R1P1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms