Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Taf7Q9R1C0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Taf7Q9R1C0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Taf7Q9R1C0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Taf7Q9R1C0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms