Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trex2Q9R1A9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trex2Q9R1A9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trex2Q9R1A9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms