Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plod1Q9R0E2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plod1Q9R0E2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plod1Q9R0E2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.5 ms