Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Lamc3Q9R0B6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Lamc3Q9R0B6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Lamc3Q9R0B6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms