Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS3

Numb, Protein numb homolog, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumbQ9QZS3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NumbQ9QZS3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NumbQ9QZS3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms