Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms