Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ripk3Q9QZL0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ripk3Q9QZL0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ripk3Q9QZL0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms