Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ercc4Q9QZD4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ercc4Q9QZD4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms