Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clic4Q9QYB1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clic4Q9QYB1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Clic4Q9QYB1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms