Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tomm40Q9QYA2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms