Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY24

Zbp1, Z-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbp1Q9QY24 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbp1Q9QY24 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbp1Q9QY24 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbp1Q9QY24 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbp1Q9QY24 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbp1Q9QY24 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbp1Q9QY24 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms