Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxe3Q9QY14 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxe3Q9QY14 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxe3Q9QY14 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxe3Q9QY14 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxe3Q9QY14 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxe3Q9QY14 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxe3Q9QY14 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxe3Q9QY14 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxe3Q9QY14 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxe3Q9QY14 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxe3Q9QY14 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxe3Q9QY14 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxe3Q9QY14 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxe3Q9QY14 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxe3Q9QY14 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxe3Q9QY14 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxe3Q9QY14 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxe3Q9QY14 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms