Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim44Q9QXA7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim44Q9QXA7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim44Q9QXA7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms