Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Homer2Q9QWW1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Homer2Q9QWW1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms