Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc4Q9QUQ5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trpc4Q9QUQ5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms