Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Habp4Q9JKS5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Habp4Q9JKS5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms