Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AtrQ9JKK8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AtrQ9JKK8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms